Feeds:
Posts
Comments

Sebelum menjawab pertanyaan di atas, ada baiknya Anda mengetahui beberapa hal tentang grup DNAR. Grup ini dibentuk oleh Dr. Su’udi dan disediakan untuk mahasiswa S1 dan S2 yang ingin melengkapi Tugas Akhir (TA) -nya di bidang Bioteknologi, khususnya Bioteknologi Tumbuhan. Beberapa hal yang perlu diketahui adalah sebagai berikut:

  1. Seluruh anggota akan mendapatkan fasilitas untuk penelitian.
  2. Setiap mahasiswa akan disediakan topik untuk TA-nya.
  3. Desain eksperimen jelas, terarah, dan terorganisir dengan baik.
  4. Mahasiswa yang memiliki IPK di atas 3.5 didukung agar bisa lulus cumlaude.
  5. Setiap anggota akan bekerja dalam tim, agar pekerjaan menjadi lebih ringan.
  6. Setiap mahasiswa dibimbing agar bisa menulis artikel dengan baik dan benar.
  7. Ada meeting rutin untuk membahas progress dan hal-hal terkait penelitian.
  8. Setiap anggota otomatis terdaftar di GLOSH program yang dikelola Keluarga Alumni Biologi (KABio).
  9. Harapannya setiap member melanjutkan studi pasca (S2 & S3) segera setelah lulus.

Hal-hal di atas tersebut yang mungkin membedakan grup ini dengan lainnya. Selain itu, grup ini lebih mengutamakan KUALITAS bukan kuantitas, sehingga jumlah anggota dibatasi. Maka, siapkan diri Anda dengan percaya diri.

Untuk menjadi anggota DNAR, Anda bisa mengisi dan mengirim formulir pendaftaran yang berisi:

Nama               :

NIM                :

IPK Terkini     :

Email               :

Nomor HP       :

Motivasi Anda (uraikan dalam bentuk paragraf):

Setelah semua data terisi, Anda bisa mengirim ke email: msuudi.rda@gmail.com dengan melampirkan CV dan transkrip. Setelah itu proses skrining dokumen dilakukan dan dilanjutkan dengan interview. Pemberitahuan akan disampaikan melalui email atau SMS/WA.

Advertisements

DNA Research Group is a part of Laboratory of Botany and Biotechnology, Biology Department, FMIPA, University of Jember. Established in the beginning of 2018, our group focused on the utilization of DNA as a tool for detection, identification and modification of biological materials. On April 2018, University of Jember through LP2M creates Kelompok Riset (KeRis) program to supports any research group with regular funding for research activities. In KeRis program, our group registered as DNA SAKTI (DNA Sequence Authenticity as Key determinant for Tropical plants of Indonesia). As illustrated in our name, the main project of this group is DNA barcoding for tropical plants. Instead of barcoding, we also provide other research topics which are available for students (undergraduate and graduate) for completing their final duty getting the degree. In brief, our research topics are: 1) DNA Barcoding, 2) Functional Genomics and Physiology, 3) DNA Manipulation, and 4) Pathogen Detection. Further details about our activities, you may visit our laboratory at Microbiology building 2nd floor FMIPA, University of Jember.

Salah satu cara untuk mengetahui fungsi suatu gene adalah dengan mengurangi atau menghilangkan ekspresinya. 

Dalam bidang Genetik dan Bioteknologi, seringkali kita menemukan istilah “Overexpression (Overekspresi)” atau biasa disingkat menjadi “OX”. Dari pemilihan kata tersebut tentunya bisa dipahami bahwa overekspresi merupakan pengungkapan untuk menunjukkan ekspresi yang berlebih dari suatu gen. Teknik overekspresi juga merupakan salah satu cara untuk mempelajari atau mengeksplorasi fungsi sebuah gen.

Dalam kondisi normal, suatu organisme (manusia, hewan, tanaman, mikroba, etc.) memiliki jumlah gen atau gene product (protein) dengan tingkatan ekspresi yang tepat/ sesuai. Teknik overekspresi dipakai para ilmuwan untuk menjawab pertanyaan “Apakah akibat yang ditimbulkan ketika suatu gen berada dalam kondisi berlebih?” dan “Apakah kondisi tersebut memiliki efek terhadap gen lainnya dan berpengaruh terhadap produk yang dihasilkan?”.

Pada umumnya teknik overekspresi dilakukan dengan cara mengisolasi (kloning) sebuah gen yang sudah diketahui fungsinya, dan kemudian ditransformasikan ke organisme tujuan. Organisme tujuan yang dimaksud di sini bisa dari organisme yang sama, misalnya gen dari padi dioverekspresikan di padi, atau bisa juga organisme yang berbeda, misalnya gen dari bakteri dioverekspresikan di tanaman. Jika organisme tujuan tersebut berbeda dengan organisme dimana gen tersebut diisolasi, maka istilah tersebut dikenal dengan overexpression in heterologous organism. Secara ringkas, teknik overekspresi ini bisa dilihat di gambar berikut [1]:

F2.large

Perumpamaan paling mudah untuk menjelaskan teknik overekspresi adalah begini. Misal sebuah pabrik gula memproduksi sebanyak 200 ribu ton per tahun, bagaimana produksi per tahunnya jika mesin dan tenaga kerjanya ditambah menjadi dua atau beberapa kali lipat?

Contoh teknik overekspresi yang telah berhasil adalah rekayasa padi emas (Golden Rice) dengan cara memasukkan gen PSY dari tanaman bunga Daffodil ke padi [2], yang dilanjutkan dengan rekayasa padi emas generasi 2 (Golden Rice 2) dengan memasukkan gen PSY dari jagung ke padi [3]. Artikel tentang Golden Rice bisa dilihat di blog ini (Judul: Golden Rice: Dulu, Kini, dan Nanti).

Contoh lainnya adalah Tebu Tahan Kekeringan yang dirakit oleh Prof Bambang Sugiharto (Universitas Jember) bersama tim peneliti dari P3GI dan PT Perkebunan Nusantara yang pada awal bulan ini diberitakan di jurnal bergengsi level internasional yaitu Nature Biotechnology [4]. Tebu ini dirakit dengan teknik overekspresi gen betA yang menyandi protein choline dehydrogenase (CDH) yang berasal dari bakteri Rhizobium meliloti.

Referensi:

1. Prelich G. Gene Overexpression: Uses, Mechanisms, and Interpretation. Genetics 2012; 190 (3): 841-854.

2. Ye, X. et al. Engineering the provitamin A (beta-carotene) biosynthetic pathway into (carotenoid-free) rice endosperm. Science 2000; 287: 303-305.

3. Paine, J.A. et al. Improving the nutritional value of Golden Rice through increased pro-vitamin A content. Nature Biotech 2005; 24(4): 482-487.

4. Waltz E. Beating the Heat. Nature Biotech 2014; 32: 610-613.

Benarkah? Bagaimana Anda tahu itu semua?

Bagi yang mempelajari Biologi tentu sudah mengetahui bagaimana proses terjadinya fertilisasi pada manusia. Secara singkat, hanya ada satu sel sperma terpilih yang akan membuahi sel telur. Sel sperma terpilih tersebut adalah sel yang paling kuat, paling energik, paling cerdas, paling berkualitas dan paling menarik, karena sel telur memiliki kemampuan dan kemauan serta otoritas untuk memilih sel sperma yang boleh membuahinya.

Jadi, setiap manusia sebenarnya adalah makhluk terpilih yang seharusnya memiliki kemampuan utk berjuang menjadi yang terbaik.

Academic Supervisor

Academic supervisor (AS) adalah orang yang membimbing kita selama menjalani studi. Mereka bisa sebagai profesor, ketua lab, atau direktur di sebuah perusahaan riset. Jika diumpamakan sebuah keluarga maka AS bisa disebut sebagai kepala keluarga, karena dia lah yang menentukan arah dan tujuan sebuah perjalanan.

Untuk mereka yang menjalani studi secara menyeluruh (jenjang S1 sampai S3), tentunya akan/sedang/telah merasakan bimbingan dari beberapa AS dengan berbagai karakter. Supervisor saat S1 tentunya berkarakter yang berbeda dengan ketika mengenyam studi S2 atau S3. Yang perlu diingat adalah setiap laboratorium memiliki aturan yang berbeda, yang biasanya mencerminkan karakter pemiliknya (professor/ ketua lab). Dan pada umumnya semua anggota lab harus mematuhi segala tata tertib yang sudah dibuat, baik yang tertulis atau pun yang tidak tertulis.

Ada lab yang mewajibkan mahasiswanya datang sebelum prof.nya datang dan pulang setelah prof.nya pulang. Ada juga yang mewajibkan datang sesuai dengan jam kerja yang sudah ditentukan (misal jam 9 pagi sampai jam 6 sore, atau jam 9 pagi sampai jam 10 malam, dsb). Ada juga aturan lab yang tidak mengikat anggota lab.nya, artinya mereka bisa datang dan pergi setiap saat asal semua target dan kerjaan beres.

Terlepas dari aturan lab, karakter prof. juga perlu dikenali untuk memudahkan kelancaran studi. Ada yang berkarakter pendiam (tidak banyak ngomong), tapi tiba-tiba memberikan surat pemecatan menjadi mahasiswanya. Ada yang bertipe workholic (gila kerja) sehingga tanpa melihat waktu, terus memberikan pekerjaan terhadap bimbingannya. Selain itu, ada yang berkarakter temperamen, sehingga mahasiswanya tidak pernah melihat senyum prof. kecuali di hari wisuda. Ada juga yang berkarakter “take and give”, yaitu prof. memperlakukan mahasiswanya sesuai hasil kerja yang telah dicapai.

Masih banyak aturan lab dan karakter prof. yang tidak tertulis di blog ini. Apa pun aturan lab. yang berlaku, selama tidak mengganggu menjalankan ibadah agama dan masih menghormati nilai-nilai kemanusiaan, InysAllah semuanya masih bisa diterima. Bahkan bisa jadi kerja keras yang dijalani selama menempuh studi merupakan loncatan tertinggi menuju sebuah kesuksesan yang lebih besar, lebih bermanfaat dan lebih barokah.

Alhamdulillah, selama penulis mengenyam studinya di Korea, penulis telah mengalami bermacam aturan lab. yang memang berbeda di setiap tempat atau universitas. Penulis juga merasakan bimbingan beberapa supervisor yang memiliki karakter berbeda.

슬라이드1

Semoga suatu saat nanti, penulis bisa menyimpul segala hal-hal baik yang telah dijalani di berbagai lab. dan memilah karakter-karakter dari supervisors untuk diaplikasikan nanti ketika penulis menjadi Academic Supervisor. Semoga…

Alhamdulillah,

Publikasi tentang OsCCS52B termasuk yang paling sering diunduh di PCTOC, Journal of Plant Biotechnology.

CB-PCTOC